芗城因芗江而名。芗江，原指九龙江北溪（今芗城区浦南镇至龙文区郭坑镇扶摇村以东）一段河流。明嘉靖《龙溪县志》载有“芗江书院”，即位于该段江岸，其附近有一古渡口，称芗洲渡（明嘉靖《龙溪县志》）也称香洲渡（清乾隆《龙溪县志》）。随着年代变迁，芗江涵盖河段逐渐扩展，至民国时期，九龙江西、北溪流经漳州城附近段落均被称为芗江，芗江也成为漳州城的代称。中华人民共和国成立后，漳州城中具有地方标志性的宾馆“芗江宾馆”（今芗江酒楼）即以其名命之。1985年地市合并，原龙溪地区改为漳州市，原漳州市（县级）取芗江之芗字，改称芗城区。今芗城地名专指漳州市区，也可为芗城区简称。